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Très simplement les assets sont bien téléchargés mais à l'URL assets/ c'est les données "internes" qui se trouvent, pas les données téléchargées; il faudrait faire un truc équivalent au patchResponse (modif des contenus pour pointer les media vers le filesystem).

Il me semble :

• modifier le refreshAssets pour s'exécuter dans le callback d'un window.requestFileSystem, pour avoir accès au fs
• (en passant je note qu'on fait LocalFileSystem.TEMPORARY, il me semble qu'on devrait plutôt faire LocalFileSystem.PERSISTENT)
• dans la boucle "Refresh stylesheets", pour les différents css, vérifier s'il existe en local (http://stackoverflow.com/questions/10294166/how-to-check-a-files-existence-in-phone-directory-with-phonegap), dans un callback (toujours des callbacks…), si ça a marché prendre la version du filesystem, sinon celle assets/foobar.css.
• il y a une vérification faite sur el.href === file, qui ne va plus marcher, il faudra taper sur le <link> un attribut supplémentaire, qui ne contiendra pas tout le path.

Non, c'est encore plus simple ce qu'il faut faire.

À l'initialisation de l'application on récupère un handle sur le file system (c'est déjà le cas et on s'en sert juste pour faire app.rootPath = fileSystem.root.toURL(); on pourrait plutôt simplement converver l'objet fileSystem). Si sur le filesystem il n'y a pas déjà de assets.zip décompressé, on l'y décompresse (ça veut dire qu'on shippe dans l'application un fichier assets.zip plutôt que le répertoire assets/). À partir de là, tout le temps, partout, pour les css mais aussi pour les fichiers js, on fait référence aux fichiers décompressés; on n'a pas à chaque fois se poser la question d'où regarder.

Sans doute a-t-on besoin d'ajouter un timestamp formel quelque part, pour déterminer si à l'installation d'une nouvelle version de l'application il faut écraser les assets existants par ceux distribués dans l'application. (je troue que de toute façon ça aiderait beaucoup de ne pas juste après l'installation de l'application afficher un message disant que des mises à jour sont dispos).

Pour continuer à fonctionner hors device, si window.requestFileSystem est vide, le window.appRoot il continue à être initialisé à DEBUG_WWW_URL mais plutôt qu'être mise à http://localhost/~ghis/momo/www/, elle est initialisée sur window.location.origin + window.location.pathname.

@@ -21,7 +21,7 @@

 // Constants
 var DEBUG = false;
-var DEBUG_WWW_URL = 'http://localhost/~ghis/momo/www/';
+var DEBUG_WWW_URL = window.location.origin + window.location.pathname;
 var ANIMATION_ENABLED = true;
 var ANIMATION_OUT_CLASS  = 'pt-page-moveToLeftEasing pt-page-ontop';
 var ANIMATION_IN_CLASS = 'pt-page-moveFromRight';
@@ -622,7 +623,7 @@ var app = {

         // Refresh scripts
         for(i = 0, l = page.javascripts.length; i < l; i++){
-            file = page.javascripts[i];
+            file = app.rootPath + page.javascripts[i];
             found = false;
             els = document.getElementsByTagName("script");
             for (j = 0, m = els.length; j < m; j++) {
@@ -646,7 +647,7 @@ var app = {

         // Refresh stylesheets
         for(i = 0, l = page.stylesheets.length; i < l; i++){
-            file = page.stylesheets[i];
+            file = app.rootPath + page.stylesheets[i];
             found = false;
             els = document.getElementsByTagName("link");
             for (j = 0, m = els.length; j < m; j++) {